Margherita nasce il 22 luglio 1647 a Lauthecourt, quintogenita di Claudio Alacoque e di Filiberta Lamyne. Dopo due giorni viene battezzata.
All'età di quattro anni viene affidata alle cure della madrina di Battesimo e va a vivere presso di lei nel castello di Corcheval. L'11 dicembre 1655 muore suo padre di soli 40 anni. Torna in famiglia; viene però affidata ad un collegio di Clarisse, dove riceve la prima Comunione. Rimane presso le Clarisse solo due anni perché si ammala gravemente a tal punto da non poter nemmeno camminare. Guarisce per un voto fatto alla Vergine. Scrive: "Poiché non si trovava nessun rimedio al mio male, i miei fecero un voto alla Santa Vergine promettendole che, se mi avesse guarita, sarei diventata, un giorno, una delle sue figlie. Il voto era stato appena da me formulato, che fui subito guarita..." (A. 6).
In un periodo difficile per tutta la sua famiglia, Margherita impara ad accettare le ristrettezze e la sofferenza, che sopporta con fortezza tenendo fissa negli occhi l'immagine di Gesù Crocifisso e rimanendo assorta davanti al Santissimo Sacramento. Nel 1669, a 22 anni, riceve la Cresima e aggiunge "Maria" al nome di Margherita e il 20 giugno del 1671, a 24 anni, entra nel monastero della Visitazione di Paray-le-Monial. Ammessa alla professione, il 6 novembre 1672, Margherita Maria diviene suora.
Il 27 dicembre 1673 per Suor Margherita Maria è l'inizio di un nuovo periodo della sua vita religiosa nel monastero della Visitazione, segnato da doni mistici particolari: tre rivelazioni nelle quali Gesù le manifesta il suo Cuore. Queste rivelazioni procurano molta sofferenza e incomprensione da parte della stessa superiora, per il timore che tutto fosse frutto dell'immaginazione della giovane monaca, che spesso veniva condotta per vie straordinarie.
In questo periodo l'unico suo conforto e sostegno è stato quello di incontrare Padre Claudio la Colombière che, dopo averla ascoltata, comprende che si tratta di un'anima eletta. Il Sacerdote la incoraggia e la rassicura sulla provenienza delle sue visioni interiori e la invita a ricevere con umiltà quanto il Signore le concede e ad essere sempre in atteggiamento di obbedienza e di ringraziamento.
Le tre rivelazioni:
- La prima risale al dicembre 1673
- La seconda datata nel 1674
- La terza, che passa sotto il nome di grande rivelazione ed è certamente la più importante delle tre, è avvenuta nel 1675, in un giorno dell'ottava del Corpus Domini.
Di lì a poco il culto del Sacro Cuore si sarebbe propagato nella Chiesa. Margherita Maria muore a soli 43 anni.